А,В,С для счетчика важны?

[Владимир]

при подключении счетчика 3-х фазного имеет-ли разницу какая фаза в каком месте подключена?

Вы обязаны произвести фазировку и подключать счётчик в соответствии с схемой, представленной в паспорте от завода-производителя.

если "перепутать" А,В,С счетчику плохо не будет?

Счётчику ничего не будет.

И как можно определить где А, где В и где С ?

По маркировке вводного кабеля.