Andrey, Да еще, бумагу которую Вы называете протоколом разногласий, должна называться мотивированным отказом от подписания проекта договора.
Там вы должны написать опираясь на ссылки норм ,что Вас не устраивает и требуете изменить в соответствии с нормами(правилами,законами и т.д.)